06 octubre 2009

Reportaje sobre regeneración al Dr. Ángel Raya del CMR[B]


Reportaje emitido por el programa LeonaArt de TVE 2, en el que el Dr. Ángel Raya (http://www.cmrb.eu/centre-investigacio/fitxa_personal.html?ID=4&CATEGORY2=43) muestra los laboratorios del Centro de Medicina Regenerativa de Barcelona (CMR[B]) y nos explica los proyectos actuales que se realizan en regeneración en nuestro centro.
Fuente:

Reportajes de Medicina Regenerativa en Discovery Channel

En Discovery Channel, se emitió un documental llamado "Tiempo futuro", por fortuna en youtube están disponibles videos con temática relacionada a la medicina regenerativa.

Programa: Mundo Futuro
Tema: "Regeneración celular"
Resumen: El futuro podria contener la solución para una de las experiencias mas traumáticas de la humanidad, la perdida de una parte del cuerpo. Los cientificos explora maneras que vuelvan a crecer.
La Dra. Ellen Heber-Katz del Institute Wistar (http://www.wistar.org/research_facilities/heberkatz/research.htm), estudiaba ratones a los que les faltaba partes de su sistema inmunológico, experimentando con drogas para inhibir su sistema inmunológicos y se encontró con la sorpresa que las perforaciones realizadas en las orejas (para identificarlos) volvian a crecer, al igual que su cola y garras o corazon, el tejido (habilidad presente sólo en algunos anfibios como la salamandra y el tritón), posiblemente se perdio debido a la evolución de nuestro sistema inmunológico.


Programa: Mundo Futuro
Tema: "Constructor de cuerpos"
Resumen:
Al Dr. Samuel Stupp (http://stupp.northwestern.edu/vitae/index.html) de la Northwestern University, le gusta construir y arreglar cosas, pero no usa soldadoras ni atornilladores, sino usa nanotecnología para regenerar partes del cuerpo humano. La nanotecnología es el campo de construcción de objeto y máquinas tan microscópicas que los ladrillos son efecto  moléculas, incluso más pequeños que las células: Nanofibras. Usa estructuras de nanofibras extremádamente pequeñas que operan a nivel celular, formando puente entre las células como puente en las zonas dañadas e inducen a las células a regenerarse.

Programa: Mundo Futuro
Tema: "Impresión de órganos"
Resumen: No se puede fabricar un riñon nuevo, o un hígado o un corazón, o si?. El Dr. Gabor Forgacs (http://forgacslab.missouri.edu/, http://www.physics.missouri.edu/people/GaborForgacs.html) de la University of Missouri-Columbia, y su laboratorio estan creando nuevos caminos para la creación de órganos internos. Crean los órganos células por células, literalmente imprimiendo copias de los órganos originales que nos dio la naturaleza.

Las células mantienen una memoria de su origen tisular durante la regeneación de extremidades.

Muchas de nuestras ideas sobre la memoria celular del destino y posición viene de estudios regenerativos en salamandras. Una noción popular es que las células del blastema se transdiferencian a diferentes destinos durante la regeneración de extremidades. En recientes capitulos del journal Nature, Elly M. Tanaka (Max Planck Institute of Molecular Cell Biology and Genetics; Center for Regenerative Therapies, University of Technology Dresden) y sus colaboradores cambiaron esta noción. Usando transplantes experimentales en ajolote con expresión de GFP (proteína verde fluorescente), ellos mostraron in vivo cuales células del blastema recordaban su destino y su posición de origen.

ANTECEDENTES: Durante la regeneración de extremidades, el tejido adulto se convierte en una zona de progenitoras indiferenciadas llamada Blastema que reforma los diversos tejidos de la extermidad perdida. Experimentos previos han aceptado ampliamente que los tejidos de las extremidades se desdiferencian para formar células pluripotentes.

METODOLOGIA: Esta interrogante fue reexaminada usando un transgen integrado GFP (proteina verde brillante) para rastrear los principales tejidos durante la regeneración de la extremidad perdida en la salamandra Ambystoma mexicanum (ajolote).

RESULTADOS: Sorprendentemente, hallaron que cada tipo de tejido produce células progenitoras con potencial restringido. Por eso, el blastema es una colección heterogénea de células progenitoras restringidas. En base a estos hallazgos, además se demostró que la identidad posicional es una propiedad específica de cada tipo de célula del blastema, en donde las células del blastema derivadas del cartílago mantienen su identidad posicional pero las que derivan de las células de Schwann no lo hacen. Los resultados mostraron que el complejo fenómeno de la regeneración de extremidades puede ser llevado a cabo sin una completa desdiferenciació al estado pluripotencial, una conclusión con importantes implecaciones para la medicina regenerativa.

Fuentes:
  • Johnson SL. Memory of fate and position, colorized. Dev Cell. 2009 Jul;17(1):5-6.
  • Se resuelve uno de los misterios de la regeneración de miembros. Disponible en: http://ltal.spaces.live.com/blog/cns!29E4011E7CD677DD!1114.entry
  • Kragl M, Knapp D, Nacu E, Khattak S, Maden M, Epperlein HH, Tanaka EM. Cells keep a memory of their tissue origin during axolotl limb regeneration. Nature. 2009 Jul 2;460(7251):60-5. Disponible en: http://www.nature.com/nature/journal/v460/n7251/abs/nature08152.html
    • Astract: During limb regeneration adult tissue is converted into a zone of undifferentiated progenitors called the blastema that reforms the diverse tissues of the limb. Previous experiments have led to wide acceptance that limb tissues dedifferentiate to form pluripotent cells. Here we have reexamined this question using an integrated GFP transgene to track the major limb tissues during limb regeneration in the salamander Ambystoma mexicanum (the axolotl). Surprisingly, we find that each tissue produces progenitor cells with restricted potential. Therefore, the blastema is a heterogeneous collection of restricted progenitor cells. On the basis of these findings, we further demonstrate that positional identity is a cell-type-specific property of blastema cells, in which cartilage-derived blastema cells harbour positional identity but Schwann-derived cells do not. Our results show that the complex phenomenon of limb regeneration can be achieved without complete dedifferentiation to a pluripotent state, a conclusion with important implications for regenerative medicine.
  • Elly M. Tanaka (Center for Regenerative Therapies, University of Technology Dresden): http://www.crt-dresden.de/index.php?id=46
    elly.tanaka@crt-dresden.de

05 octubre 2009

Análisis proteómico de la regeneración de extremidades: cambios durante el inicio de la regeneración

RESUMEN:
Durante la regeneración epimorfica de extremidades de anfibios, los cambios metabólicos producidos en la lesión permiten desdiferenciación celular y formación de un blstema, pero porcos de estos detalles han sido elucidados. Aqui se reporta el primer análisis proteómico global comparativo del perfil  de proteínas abundantes en extremidades de larvas de ranas Xenopus laevis en la regeneración epimorfica (etapa 53) en el tiempo de amputación (0dPA) y 3 días post-amputación cuando la regeneración del blastema está desarrollandose (3dPA).

Se identificaron y cuantificaron 1517 peptidos, de los cuales 1067 fueron identificados con elevado ID de confianza. De estas 1067 proteínas, 489 mostraron cambios significativos en la cantidad entre 2 grupos. Tomando en cuenta la similitud de los peptidos cuyos plegamientos fueron de 20%, y no incluyendo a los peptidos con plegamientos por debajo de lo observado para estandar internos (lizosima de pollo),  fueron capaces de identificar 145 peptidos elevados en 3dPA relacionados a 0dPA y 220 peptidos en  0dPA relacionados a 3sPA. En este reporte, se enfocan en estas proteínas que se elevaron en tejidos 3dPA relacionados a 0sPA. En esta clase de miembros de la familia de anexinas (ej: ANXA1, ANXA2, ANXA5) y la ANXA2-asociada a S100A10, tuvieron importancia inmunoregulatoria en otros sistemas y fueron también diferencialmente expresadas en blastema en las etapas 53 y 57 3dPA y 5dPA en estudios de microarrays previos. Además de revelar la posible modulación de la inflamación durante la regeneración de extremidades en anfibios, este estudio proteómico también provee significancia en la desdiferenciación al mostrar inclusive proteínas conocidas en la sobre-regulación (up-regulation) para caracterizar varias células troncales.

Fuente:
  • Imagen modificada de: http://www.engr.pitt.edu/ldavidson/NieuwkoopFaber/Frame1.html 
  • King MW, Neff AW, Mescher AL. Proteomics analysis of regenerating amphibian limbs: changes during the onset of regeneration. Int J Dev Biol. 2009;53(7):955-69. Disponible en: http://www.ijdb.ehu.es/web/paper.php?doi=082719mk
    •  Abstract: During amphibian epimorphic limb regeneration, local injury produces metabolic changes that lead to cellular dedifferentiation and formation of a blastema, but few details of these changes have been elucidated. Here we report the first global proteomic analysis of epimorphic regeneration comparing the profiles of abundant proteins in larval limbs of the anuran Xenopus laevis (stage 53) at the time of amputation (0dPA) and 3 days post-amputation when the regeneration blastema is developing (3dPA). We identified and quantified 1517 peptides, of which 1067 were identified with high peptide ID confidence. Of these 1067 proteins, 489 showed significant changes in quantity between the two groups. Taking into account identical peptides whose fold changes were within 20%, and not including peptides whose fold changes were below the observed fold changes of peptides for the internal standard (chicken lysozyme), we were able to identify 145 peptides elevated in 3dPA relative to 0dPA and 220 peptides in 0dPA relative to 3dPA. In this report, we focus on those proteins that were elevated in the 3dPA tissue relative to 0dPA. In this class were members of the annexin family (e.g. ANXA1, ANXA2, ANXA5) and the ANXA2-binding partner S100A10, which have important immunoregulatory roles in other systems and were also shown to be differentially expressed in stage 53 and 57 3dPA and 5dPA blastemas in our previous microarray studies. Besides elucidating the possible modulation of inflammation during amphibian limb regeneration, our proteomic study also provides insight into dedifferentiation by revealing up-regulation of proteins known to characterize many stem cells. Key words: annexin, inflammation, limb, regeneration, Xenopus
  • Michael W. King - Indiana University Center for Regenerative Biology and Medicine, 1Indiana University School of Medicine-Terre Haute: miking@iupui.edu;
    Web: http://themedicalbiochemistrypage.org/kingfact.html 

Estructura y filogenia de Prod1, un miembro de 3 proteinas de la superfamilia de Dedos de Zinc implicada en la regeneración de miembros en Salamandras.

Notophthalmus viridescens (© 2005 Henk Wallays: henk.wallays@pandora.be.)

ANTECEDENTES:
después de la amputación de las extremidades, los tritones y salamandras tienen la capacidad de regenerar los tejidos perdidos por medio complejos procesos que ocurren en la zona de la herida. Inicialmente estas células se desdiferencian a un estado apropiado para regenerar las estructuras perdidas. Fundamentalmente, las células desdiferenciadas poseen memoria de su origen a lo largo del eje proximodistal (PD), una propiedad conocida como identidad posicional. Notophthalmus viridescens Prod1 es una molécula que se encuentra en la superficie celular, y una de las 3 proteínas pertenecientes a la superfamilia de dedos de Zinc (TPP) involucrada en la especificación de la identidad PD en el miembro en el tritón. La superfamilia TFP es un grupo con gran diversidad de proteínas de metazoos que incluyen desde toxinas de serpientes venenosas, receptores transmembrana de mamíferos y diversas moléculas de señalización. 


METODOLOGÍA/HALLAZGOS PRINCIPALES: Con el objetivo de identificar potenciales ortologos de Prod1, se halló su estructura 3D y se comparó a otras TFPs conocidas usando técnicas filogenéticas. El análisis mostró que la estructura 3D de TFP se agrupa en diferentes categorías de acuerdo a su función. El grupo de Prod1 con otras proteínas de superficie celular  con dominios TFP incluyen el complemento CD59 y el dominio C-terminal de plasminógeno activador tipo uroquinasa. Para inferir ortología, se basó en el alineamiento múltiple de secuencias de representativas de los miembros de la familia TFP para construirse y analizarse por métodos filogenéticos. Prod1 ha sido propuesto ser el CD59 de salamandra pero nuestro análisis falla en soportar esta asociación. Prod1 no se ajusta bien a ninguna familia de TFP en mamíferos y este resultado se soporta en la identificación de ortólogos putativos de CD59 y N. viridescens Prod1 en las secuencia de datos para salamandra Ambystoma tigrinum.

Ambystoma tigrinum (© JD Willson, 2006)

CONCLUSIONES/SIGNIFICANCIA:
Los datos disponibles sugieren que Prod1, y por su función en codificar identidad PD, se limita sólo a salamandras. La ausencia de capacidad comparable de regeneración de extremidades en otros vertebrados adultos podría correlacionarse con la ausencia del gen Prod1.

Fuente:
  • Garza-Garcia A, Harris R, Esposito D, Gates PB, Driscoll PC. Solution structure and phylogenetics of Prod1, a member of the three-finger protein superfamily implicated in salamander limb regeneration. PLoS One. 2009;4(9):e7123. Dispobible en: http://www.pubmedcentral.nih.gov/articlerender.fcgi?tool=pubmed&pubmedid=19771161
    • Abstract: Following the amputation of a limb, newts and salamanders have the capability to regenerate the lost tissues via a complex process that takes place at the site of injury. Initially these cells undergo dedifferentiation to a state competent to regenerate the missing limb structures. Crucially, dedifferentiated cells have memory of their level of origin along the proximodistal (PD) axis of the limb, a property known as positional identity. Notophthalmus viridescens Prod1 is a cell-surface molecule of the three-finger protein (TFP) superfamily involved in the specification of newt limb PD identity. The TFP superfamily is a highly diverse group of metazoan proteins that includes snake venom toxins, mammalian transmembrane receptors and miscellaneous signaling molecules. With the aim of identifying potential orthologs of Prod1, we have solved its 3D structure and compared it to other known TFPs using phylogenetic techniques. The analysis shows that TFP 3D structures group in different categories according to function. Prod1 clusters with other cell surface protein TFP domains including the complement regulator CD59 and the C-terminal domain of urokinase-type plasminogen activator. To infer orthology, a structure-based multiple sequence alignment of representative TFP family members was built and analyzed by phylogenetic methods. Prod1 has been proposed to be the salamander CD59 but our analysis fails to support this association. Prod1 is not a good match for any of the TFP families present in mammals and this result was further supported by the identification of the putative orthologs of both CD59 and N. viridescens Prod1 in sequence data for the salamander Ambystoma tigrinum. The available data suggest that Prod1, and thereby its role in encoding PD identity, is restricted to salamanders. The lack of comparable limb-regenerative capability in other adult vertebrates could be correlated with the absence of the Prod1 gene
  • Paul C. Driscoll - Division of Molecular Structure, MRC National Institute for Medical Research, London, United Kingdom.
    Website: http://www.biochem.ucl.ac.uk/~driscoll/; http://www.smb.ucl.ac.uk/molecular-microbiology/professor-paul-driscoll.html
    email: pdrisco@nimr.mrc.ac.uk

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